За этот же период научными коллективами под руководством Института проведены также работы по заказам крупных российских промышленных структур, связанные с разработкой частных бизнес-моделей организации и модернизации промышленной деятельности заказчиков (в частности, Стратегия развития Корпорации «Аэрокосмическое оборудование» на период до 2015 года в структуре Государственной корпорации «Ростехнологии», «Концепция реструктуризации промышленных активов ОАО «Объединенный авиаприборостроительный консорциум» и др.).

Основным профилем деятельности Института нового индустриального развития является разработка научных проектов по стратегическим вопросам развития наукоемких и высокотехнологичных секторов обрабатывающей промышленности, а также по обоснованию промышленной политики на различных уровнях управления. Институт разрабатывает концепции и программы развития промышленности регионов, промышленных кластеров, диверсификации, реструктуризации и развития бизнеса по заказам крупных промышленных компаний и интегрированных структур. Осуществляется деятельность по изданию научных и аналитических материалов.

Деятельность Института положительно оценена Российской академией наук: постановлением № 2 от 21.05.2012 г. Общего собрания Отделения общественных наук РАН Институт нового индустриального развития включен в число научных организаций РАН, находящихся под научно-методическим руководством Отделения общественных наук РАН.